chr1	9002369	9002370	chunk0001_295_1	81.5387	SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr1	9001819	9002808	-239953614	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	1 9001819 9002808 LTR5B 0 +
chr1	11890829	11890830	chunk0002_1_1	8.84892	AR_DHT_Control	chr1	11890698	11891158	-237065264	+	LTR5B	LTR	ERVK	548	1002	0	1 11890698 11891158 LTR5B 0 +
chr1	46396638	46396639	chunk0004_194_1	63.0308	SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;AR_DHT_Control	chr1	46395863	46396842	-202559580	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	8 46395863 46396842 LTR5B 0 -
chr1	165092663	165092664	chunk0012_449_1	6.04605	AR_DHT_Control	chr1	165092582	165093558	-83862864	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	2 165092582 165093558 LTR5B 0 +
chr1	165093386	165093387	chunk0012_450_1	12.9588	AR_DHT_Control	chr1	165092582	165093558	-83862864	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	2 165092582 165093558 LTR5B 0 +
chr1	173475245	173475246	chunk0013_435_1	47.64534	SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr1	173474424	173475408	-75481014	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	2 173474424 173475408 LTR5B 0 +
chr1	227606415	227606416	chunk0019_250_1	14.1597	AR_DHT_Control	chr1	227606015	227607021	-21349401	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	3 227606015 227607021 LTR5B 0 -
chr10	16250778	16250779	chunk0022_318_1	10.4518	AR_DHT_Control	chr10	16249997	16250977	-117546445	+	LTR5B	LTR	ERVK	12	1002	0	3 16249997 16250977 LTR5B 0 +
chr11	62860995	62860996	chunk0036_185_1	9.28589	SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr11	62860433	62861082	-72225540	-	LTR5B	LTR	ERVK	-376	626	1	6 62860433 62861082 LTR5B 0 -
chr11	93745234	93745235	chunk0038_402_1	34.90059	AR_DHT_Control;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr11	93744696	93745652	-41340970	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	7 93744696 93745652 LTR5B 0 -
chr13	110838014	110838015	chunk0058_388_1	157.5681	AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr	chr13	110837233	110838214	-3526114	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	1 110837233 110838214 LTR5B 0 -
chr14	88024551	88024552	chunk0063_401_1	16.55774	AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr14	88024340	88025306	-19018412	+	LTR5B	LTR	ERVK	2	1002	0	1 88024340 88025306 LTR5B 0 +
chr14	103525666	103525667	chunk0065_340_1	166.5912	AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr	chr14	103524915	103525904	-3517814	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	1 103524915 103525904 LTR5B 0 -
chr15	78221733	78221734	chunk0070_441_1	29.8506	SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;AR_DHT_Control	chr15	78221051	78222039	-23769150	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	1 78221051 78222039 LTR5B 0 -
chr15	79935972	79935973	chunk0071_47_1	12.546	AR_DHT_Control	chr15	79935247	79936240	-22054949	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	2	1 79935247 79936240 LTR5B 0 -
chr16	388612	388613	chunk0072_11_1	82.9913	AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr	chr16	387823	388797	-89949548	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	1 387823 388797 LTR5B 0 -
chr16	2928481	2928482	chunk0073_44_1	12.0334	AR_DHT_Control	chr16	2927738	2928722	-87409623	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	1 2927738 2928722 LTR5B 0 -
chr16	29740485	29740486	chunk0074_286_1	169.0476	AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr	chr16	29740240	29741225	-60597120	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	1 29740240 29741225 LTR5B 0 +
chr16	35629165	35629166	chunk0074_416_1	24.62192	SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;AR_DHT_Control	chr16	35628808	35629805	-54708540	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	1 35628808 35629805 LTR5B 0 +
chr17	7088552	7088553	chunk0078_245_1	51.8426	SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr17	7088332	7089145	-76168296	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	829	-173	1 7088332 7089145 LTR5B 0 +
chr17	7159851	7159852	chunk0078_249_1	55.1876	SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr17	7159071	7160057	-76097384	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	1 7159071 7160057 LTR5B 0 +
chr17	18303727	18303728	chunk0079_380_1	64.1056	SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr17	18302963	18303938	-64953503	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	998	-4	1 18302963 18303938 LTR5B 0 +
chr17	19519756	19519757	chunk0079_406_1	31.33589	SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;AR_DHT_Control	chr17	19519710	19520714	-63736727	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1000	-2	1 19519710 19520714 LTR5B 0 +
chr18	46088550	46088551	chunk0088_142_1	7.36432	AR_DHT_Control	chr18	46088309	46089299	-34283986	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	1 46088309 46089299 LTR5B 0 +
chr19	9784708	9784709	chunk0091_214_1	8.75953	SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr	chr19	9784065	9785035	-48832581	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	1 9784065 9785035 LTR5B 0 -
chr19	35129858	35129859	chunk0092_336_1	40.77984	SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;AR_DHT_Control;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr	chr19	35129352	35130347	-23487269	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	1 35129352 35130347 LTR5B 0 +
chr19	51960627	51960628	chunk0093_282_1	111.017	SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;AR_DHT_Control;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr	chr19	51960242	51961231	-6656385	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	1 51960242 51961231 LTR5B 0 -
chr19	51983602	51983603	chunk0093_285_1	91.28165	SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;AR_DHT_Control;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr	chr19	51982961	51983945	-6633671	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1001	-1	1 51982961 51983945 LTR5B 0 +
chr19	52026893	52026894	chunk0093_287_1	8.16452	AR_DHT_Control	chr19	52026212	52027168	-6590448	+	LTR5B	LTR	ERVK	5	1002	0	1 52026212 52027168 LTR5B 0 +
chr19	52339041	52339042	chunk0093_291_1	81.7909	AR_DHT_Control	chr19	52338779	52339732	-6277884	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	1 52338779 52339732 LTR5B 0 -
chr19	52723789	52723790	chunk0093_299_1	34.16828	AR_DHT_Control;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr	chr19	52723560	52724546	-5893070	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	3	1 52723560 52724546 LTR5B 0 -
chr19	53444042	53444043	chunk0093_305_1	14.2911	AR_DHT_Control	chr19	53443774	53444761	-5172855	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	1 53443774 53444761 LTR5B 0 +
chr19	53498233	53498234	chunk0093_307_1	67.42626	AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr	chr19	53497640	53498598	-5119018	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	1 53497640 53498598 LTR5B 0 +
chr19	57823895	57823896	chunk0093_426_1	32.15446	SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;AR_DHT_Control	chr19	57823626	57824595	-793021	+	LTR5B	LTR	ERVK	3	1002	0	1 57823626 57824595 LTR5B 0 +
chr19	57824379	57824380	chunk0093_427_1	6.13843	AR_DHT_Control	chr19	57823626	57824595	-793021	+	LTR5B	LTR	ERVK	3	1002	0	1 57823626 57824595 LTR5B 0 +
chr2	208257440	208257441	chunk0106_426_1	46.5646	SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;AR_DHT_Control	chr2	208256756	208257743	-33935786	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	2	2 208256756 208257743 LTR5B 0 -
chr20	812602	812603	chunk0109_45_1	6.10054	SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr20	811835	812820	-63631347	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	2 811835 812820 LTR5B 0 -
chr20	3023255	3023256	chunk0109_130_1	37.03491	SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;AR_DHT_Control	chr20	3022939	3023895	-61420272	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	2 3022939 3023895 LTR5B 0 +
chr20	25550611	25550612	chunk0111_193_1	22.60822	AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr20	25550342	25551333	-38892834	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	2 25550342 25551333 LTR5B 0 -
chr20	34135782	34135783	chunk0111_389_1	7.36432	AR_DHT_Control	chr20	34135593	34136578	-30307589	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	2 34135593 34136578 LTR5B 0 +
chr20	34159415	34159416	chunk0111_391_1	28.8847	SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;AR_DHT_Control	chr20	34158607	34159549	-30284618	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	958	-44	2 34158607 34159549 LTR5B 0 +
chr20	34252856	34252857	chunk0111_396_1	104.8759	SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr20	34252111	34253095	-30191072	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	22	2 34252111 34253095 LTR5B 0 -
chr22	23547968	23547969	chunk0117_261_1	11.7184	AR_DHT_Control	chr22	23547937	23548428	-27270040	+	LTR5B	LTR	ERVK	477	1002	0	2 23547937 23548428 LTR5B 0 +
chr3	38135455	38135456	chunk0122_405_1	16.5871	AR_DHT_Control	chr3	38135236	38136292	-160159267	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	2 38135236 38136292 LTR5B 0 -
chr4	41180	41181	chunk0136_7_1	69.2606	SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr;AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr	chr4	40540	41494	-190173061	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	13	2 40540 41494 LTR5B 0 -
chr5	43077184	43077185	chunk0151_95_1	13.1909	AR_DHT_Control	chr5	43077021	43078006	-138460253	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	3 43077021 43078006 LTR5B 0 -
chr5	95811687	95811688	chunk0155_260_1	23.9152	AR_DHT_Control	chr5	95811014	95811999	-85726260	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	3 95811014 95811999 LTR5B 0 +
chr7	32513891	32513892	chunk0178_132_1	12.1937	AR_DHT_Control	chr7	32513607	32514433	-126831540	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	167	3 32513607 32514433 LTR5B 0 -
chr7	73750068	73750069	chunk0180_357_1	273.5163	AR_DHT_Control;SRA814800_Lncap_AR_DHT_10nm_12hr;SRA057177_Lncap_AR_DHT_10nm_4hr	chr7	73749695	73750685	-85595288	-	LTR5B	LTR	ERVK	-6	996	1	3 73749695 73750685 LTR5B 0 -
chr9	136789621	136789622	chunk0207_399_1	7.26348	AR_DHT_Control	chr9	136788797	136789776	-1604941	-	LTR5B	LTR	ERVK	0	1002	1	4 136788797 136789776 LTR5B 0 -
chr9	136797247	136797248	chunk0207_400_1	10.9604	AR_DHT_Control	chr9	136796532	136797430	-1597287	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	913	-89	4 136796532 136797430 LTR5B 0 +
chr9	138133601	138133602	chunk0207_463_1	6.48643	AR_DHT_Control	chr9	138132948	138133926	-260791	+	LTR5B	LTR	ERVK	1	1002	0	4 138132948 138133926 LTR5B 0 +